美国华人生物医药科技协会(CBA)二月份热点讲座

               2月3号(周六)早上9点,室外依然满是严冬的酷寒,但是马州洛城(Rockville)的北京中医大学分校教室里早已是春意傲然,来自各行各业的一百四十多位听众们带着学习交流的期盼参加了 由美国华人生物医药科技协会(CBA)组织的教育研讨会 – “大数据在生命科学和医疗健康领域的应用“。CBA的组织者们又一次不负众望,请来了来自制药行业,咨询公司和监管机构的五位在业界颇具影响力的演讲者介绍了大数据在生命科学和医疗健康领域的应用和挑战。

             会议在李次山博士的介绍下拉开序幕 – 他欢迎大家的到来并且希望有更多的志愿者加入CBA的团队。CBA后任会长李利博士强调了CBA是以志愿者为基础的组织,CBA的使命是充当美中生物制药,政府,行业和学术界的桥梁。2018年适应精准医学发展需要的响应,CBA形成了BioMarker 生物标志物诊断和研究的特别兴趣小组。他还积极邀请大家参加6月9日即将召开的CBA第23届年会。

               Larry Liu作为TConneX公司的创始人,谈到了大数据技术如何应用​​于上市前后的药品安全监测。药物安全是关于药物不良反应或是任何意外和有害的药物反应, 这也是药物研究在晚期临床上失败的重要原因。早期的安全信息检测节省了药物开发上金钱和时间的投入,早期风险识别改进了风险管理计划。监管机构会 利用药物安全去评估关于监测系统的药物警戒计划或者分析药物上市后药物的市场发展,

同时对药物重新定位或重新调整。Larry还分享了一个用户友好的创新药物安全分析工具云基础系统:innovPV (http://pvaicloud.com)。该系统拥有检测药物安全信号的数据挖掘和分析能力。

            来自Cloudera的资深咨询顾问Roger Ding的演讲题目是“大数据Hadoop生态系统“。他详细的介绍了Hadoop的不断演变发展历程以及如何从传统数据平台过渡到Hadoop。对于Hadoop生态系统,Roger如数家珍的向大家介绍了可以无限扩张的存储系统,强大的分析功能和计算框架,以及分散式计算方法,各个核心部件的工作流程及协调,安全性和搜索。Roger自豪地表示,为了使Hadoop更快,更简单,更安全,Cloudera开发了一个企业数据中心数据管理链,以高效完成工作流程。

            在阿斯利康(AstraZeneca)担任健康信息,全球医药发展(GMD研发中心主任的王霞女士与观众分享了自己通往大数据和精准医疗的职业生涯- 如何与AZ制药公司一起发展。 她展示了大数据分析如何从描述性→诊断性→预测性→规范性在患者治疗中发挥作用的途径。同时 定义真实世界大数据(RWBD)和真实世界证据(RWE)以及在整个药物发现,开发和商业化生命周期中的潜在使用和影响。在精准医疗中还面临着很多的挑战,最重要的难点就是如何收集高质量的数据,并且让这些数据可以被接触使用并最终从中得到启示,最后把正确的医疗手段在正确的时间用在正确的病人身上。

            来自食品药品监督管理局(FDA)的首席研究员肖博士(WenMing Xiao)向大家展示了二代测序(NGS)技术如何使研究人员能够以非常大的规模和成本负担调查肿瘤细胞中的DNA突变,事实上,二代测序正在成为发现肿瘤样本突变的有用工具。然而,不同NGS平台的测序错误率在0.5%至15%这个很大范围内变化。因此,从随机测序错误中区分肿瘤细胞群中的突变将是非常困难的。为了提高突变检测的准确性,特异性和灵敏度,已经在试验和分析软件的开发上进行了大量的努力。但由于缺少参考资料,难以对这些设备或产品进行客观的评估。所以他从事这项研究的主要目标是通过揭示其所有突变事件来充分表征乳腺癌细胞系,使其可以用作评估二代测序平台,生物学检测和用于检测突变的软件工具的性能的参考材料。此外,通过使用这种细胞系评估许多因素的影响,以辨别它们对​​突变检测的准确性,特异性和敏感性的影响。最终的研究成果将为肿瘤样本中突变检测的“最佳实践”制定建议。肖博士鼓励年轻科学家考虑到生物信息学是一个很好的职业,他认为NGS(二代测序)是一种新兴的临床应用技术,其相关产品对于企业家来说是一个很好的市场。

               来自FDA的赵亮博士是量化方法和模型部门的负责人,他与大家分享的主题是“大数据在监管环境中的价值创造”,他利用FDA正在使用的四个大数据相关活动的例子,包括真实世界的研究(RWS),人类基因组数据,上市后评估以及精准医学/数字健康。他指出,除了定义大数据的三个“V”–多样性(Variety),规模性(Volume)以及及时性(Velocity)之外,其第四个维度应是“准确性(Veracity)”。如何利用数据分析上市后的量化方法以及仿制药营销评价 ,他用一个实例大数据理解TKI的生物靶点和不良反应的关系。用三期临床试验的数据分析表明kinases抑制和不良反应是一致的,证明利用一些新颖的方法,包括机器学习技术可以用于关联性分析以及预测结果。

               五位主讲人会后又回答了很多热心听众的问题,把本次研讨会推上高潮。CBA的前任会长姜緒荣,现任会长沈栋都百忙之中来到会场为大家献计献策,倾听不同的心声。会后大家一边品尝着好吃的比萨一边互相认识交流。

               大数据正在深刻影响各种商业变革。如何能高效、高速地利用这些大数据,无疑将为生命科学领域带来无限机遇。这次CBA的讲座,从如何分析利用大数据为大家提供了一个全面的视野,同时也为生命科学/数据领域的专业人士们提供了认识同行,扩大专业交际网的绝佳机会。

四月份,CBA下一个主题-“职场就业发展准备Career Readiness”,希望再次见到各位!

 

 

CHINESE BIOPHARMACEUTICAL ASSOCIATION, USA

 

   CBA 供稿      许鹏 撰稿         

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